1996年11月30日公開。全國松竹系劇場にて上映。出崎統監督作品。OVAシリーズの流れを汲む作品で、原作にはない劇場用オリジナルストーリーとして製作したもの。音楽はOVA版KARTE6より參加した川村栄二が擔當、主題歌は山根麻衣『Invisible Love』。本作最大の特徴は、キャラクターも含めた作品そのものの米國風のデザインや、患者が血を吐くシーンや頭をぶつけるシーンなどに使われた、サーモグラフィー切り替えによる演出などである。當時の最新の技術を極限まで用いた演出と、出崎監督特有の「ハーモニー」や「陰影」、「入射光」などもあり、人間の「生死」や「苦悩」をリアルに演出している。なお、2005年末、手塚眞監督によって再び映畫化された作品がブラック?ジャック ふたりの黒い醫者であるが、內容は本作とは全くの別物。なお、前述の2005年度に公開された映畫の予告に於いて「初の映畫化」と謳っているうえ、一般的なイメージとしてはこちらの映畫の方が強いために、本作のイメージは薄れつつある（※公式サイトの豆知識にメディア化作品が記載されているこの作品もそれに記載されているため否定しているわけではない）。ただしDVDレンタルはされているため見ることができる。セルDVDでの発売もされているが、こちらは在庫切れが相次いで入手困難の狀況にある。　　公開當年の1996年の12月、秋田書店からフィルムコミックが発売されている。全2巻。（1巻：ISBN 4-253-17328-4、2巻：ISBN 4-253-17329-2）　　1999年末、よみうりテレビ?日本テレビ系列にて地上波TV放送された。　　2008年12月31日（23時45分 - 25時30分）TOKYO MXにての地上波局としては異例の、年を跨いでのアニメ作品放映という形で実施された。

怪醫黑杰克劇場版是由大冢明夫,水谷優子,星野充昭,井上喜久子,若本規夫,大塚明夫,折笠愛,坂東尚樹,安西正弘,清川元夢,青森伸,秋元羊介,寶龜克壽,二又一成,村松康雄,伊井篤史,涼風真世主演的動漫全集,在1996年拍攝日本上映播出,好劇屋提供了怪醫黑杰克劇場版,怪醫黑杰克劇場版高清版,怪醫黑杰克劇場版免費在線觀看,并且還可以支持手機看,不需要下載播放器,方便廣大影迷。